استفاده از ضایعات كشاورزی ، اقتصادی ترین روش تولید پروتئین افزودنی به خوراك دام ، طیور و آبزیان است . با توجه به موضوع امنیت غذایی و به خصوص پروتئین ، در دنیا روش های مختلفی برای تولید پروتئین به روش میكروبی ایجاد شده است . این روش ها عمدتاً به ماده اولیه ای بستگی دارد كه به عنوان سوبسترا مورد استفاده قرار می گیرد . امروزه دو ماده اولیه متانول و ضایعات كشاورزی به دلیل ایمنی و سلامت غذایی ، برای تولید پروتئین ، به صورت (( ضایعات غنی شده پروتئین )) یا ((پروتئین تك یاخته ( مطرح هستند.در خصوص تولید پروتئین تك یاخته (SCP) ، فعالیتهای بسیار زیادی در دانشگاه تربیت مدرس صورت گرفته است كه می توان به تولید scp از متانول ، غنی سازی پروتئین ضایعات و محصولات فرعی كشاورزی نظیر سبوس گندم ، تفاله چغندر قند ، پساب كارخانه الكل سازی و آب پنیر اشاره كرد . لذا با توجه به انتشار مقالات متعدد در این زمینه و كسب تجارب لازم اطلاعات كامل و لازم برای صنعتی شدن تولید این محصول حیاتی وجود دارد.
Scp و ضایعات غنی شده ، از مواد اولیه مختلف از قبیل تركیبات نفتی ، گازوئیل ، متان (گاز طبیعی )، متانول و ضایعات كشاورزی تولید می شوند . در بین این مواد اولیه ، تولید scp از متانول و ضایعات كشاورزی از نظر سلامت با توجه به نوع میكروارگانیزم كاملاً ایمن هستند . اما در مورد استفاده از گاز طبیعی (متان ) برای تولید scp به دلیل وجود گازهای اكسیژن و متان ، طراحی مشكل است و ایمنی كار باید بالا باشد ، چون در اینجا با باكتری سروكار داریم ، ایمنی خاص خود را لازم دارد .

مزیت استفاده از ضایعات كشاورزی
با این حال در شرایط فعلی، اقتصادی ترین روش برای تولید این پروتئین افزودنی ، استفاده از ضایعات كشاورزی می باشد . با توجه به اینكه توانایی اصلاح محصولات كشاورزی خصوصاً اصلاح ژنتیكی وجود دارد ، ضایعات كشاورزی و حتی خود محصولات كشاورزی تجدید پذیر در مقیاس وسیعی قابل استفاده هستند . مزیت های استفاده از ضایعات كشاورزی عبارتند از:
1- ایمن و سالم بودن سوبسترای مورد استفاده
2- ایمن بودن قارچ مورد استفاده نسبت به باكتری
3- تجدید پذیر بودن و فراوان بودن ماده خام
تنها مشكل در این روش ، رشد قارچ ها نسبت به باكتری كمتراست و البته می توان بر روی بهبود آن نیز كار كرد.علیرغم اینكه استفاده از فراورده های نفت و گاز برای تولید Scp در دنیا منسوخ است ، متاسفانه دیده می شود به دلیل عدم اطلاعات كافی ، برخی بخش ها یا سازمان ها طرح تولید scp از متان یا نفت را مطرح كرده اند . با توجه به تجربیات 7 یا 8 ساله ای كه ما با وزارت جهاد كشاورزی در این خصوص داشته ایم ، این روش را كاملاً غیراقتصادی و غیرایمن می دانیم .
نكته : استفاده از ضایعات كشاورزی علاوه بر محاسن بالا، یك حسن دیگر نیز دارد و آن اینكه از نقطه نظر زیستی می توان تا حدی مشكلات محیط زیست را كم كرد و این روش هر دو موضوع توسعه پایدار یعنی استفاده از منابع تجدیدپذیر و سازگاری با محیط زیست را دارا می باشد .